Der Forschungsschwerpunkt von de.STAIR liegt auf RNA-Sequenzierungs-Analysen mit dem Ziel, Best-Practices und nutzerfreundliche Workflows für die Verarbeitung und Integration von Genexpressionsdaten zu entwickeln sowie Hilfestellung bei der Vorbereitung von Sequenzierexperimenten, der anschließenden Datenanalyse und Interpretation zu geben. Die große Heterogenität in RNA-Seq-Studiendesigns und untersuchten Organismen hat großen Einfluss auf die nachfolgende bioinformatische Analyse. Als Teil des RNA-Bioinformatik-Zentrums (RBC), das die Forschung mit RNA-Bezug innerhalb de.NBI unterstützt, vereint de.STAIR die Expertise von drei beteiligten Arbeitsgruppen, um eine flexible RNA-Seq-Analysis-Workbench für verschiedene RNA-Seq-Protokolle zu entwickeln und zu pflegen, die lokal oder in einer Cloudumgebung (wie z.B. der Open-Source-Plattform Galaxy) genutzt werden kann. Darüber hinaus bietet de.STAIR Workshops, Weiterbildungen und Screencasts für Experten und Anfänger an, um den Zugang zu RNA-Seq-Analysen zu erleichtern.