Zentrale Technologie- und Serviceeinrichtungen

Anfang 2016 hat das FLI eine „Core“-Struktur eingerichtet, in der die Facility- und Serviceeinheiten unabhängig von den einzelnen Forschungsgruppen organisiert sind. Einige Technologien (z.B. Sequenzierung, Massenspektrometrie) hatten sich im Laufe der Jahre von einer gruppeninternen Methodik zu halbautonomen Substrukturen entwickelt, die durch die vernetzte Forschungsstruktur am Institut und gruppenübergreifende Projekte allen Forschungsgruppen zur Verfügung gestellt werden sollten.

Um die Effizienz und Transparenz für alle Technologienutzer, für das Facility-Personal und die damit verbundenen, notwendigen administrativen Prozesse am FLI zu erhöhen, wurden wissenschaftliche Technologie- und Serviceeinrichtungen, sogenannte „Core Facilities und Services“ als unabhängige Einheiten aus den Forschungsgruppen ausgegliedert. Gleichzeitig wurden technologische Einrichtungen, die für die wissenschaftliche Ausrichtung des FLI geringe Relevanz hatten (Röntgen-Kristallographie und NMR-Spektrometrie), geschlossen.

Die Core Facilities (CF) werden von je einem CF Manager betreut. Ihre Aktivitäten und Entwicklung betreut ein Gruppenleiter als „Scientific Supervisor“, um technologische Entwicklungen frühzeitig abzuschätzen und erkennen zu können. Die Animal Facilities werden separat betrieben, da sie eine komplexere Organisationsstruktur aufweisen. Darüber hinaus gibt es wissenschaftliche Services (Core Services, CS), die – unterstützt von CS Managern – direkt vom Head of Core (HC) geleitet werden.

Die Technologie- und Serviceeinrichtungen leisten am FLI einen erheblichen Beitrag zu den Forschungsartikeln, im Zeitraum von 2016 bis 2018 beispielweise zu 54 % aller peer-reviewed Veröffentlichungen.

Überblick über zentrale Technologie- und Serviceeinrichtungen

Publikationen

(seit 2016)

2019

  • Metastatic-niche labelling reveals parenchymal cells with stem features.
    Ombrato L, Nolan E, Kurelac I, Mavousian A, Bridgeman VL, Heinze I, Chakravarty P, Horswell S, Gonzalez-Gualda E, Matacchione G, Weston A, Kirkpatrick J, Husain E, Speirs V, Collinson L, Ori A, Lee JH, Malanchi I
    Nature 2019, 572(7771), 603-8
  • Characterization under quasi-native conditions of the capsanthin/capsorubin synthase from Capsicum annuum L.
    Piano D, Cocco E, Guadalupi G, Kalaji HM, Kirkpatrick J, Farci D
    Plant Physiol Biochem 2019, 143, 165-75
  • Analysis of the coding sequences of clownfish reveals molecular convergence in the evolution of lifespan.
    Sahm A, Almaida-Pagán P, Bens M, Mutalipassi M, Lucas-Sánchez A, de Costa Ruiz J, Görlach M, Cellerino A
    BMC Evol Biol 2019, 19(1), 89
  • Structural insights into heme binding to IL-36α proinflammatory cytokine.
    Wißbrock* A, Goradia* NB, Kumar A, Paul George AA, Kühl T, Bellstedt P, Ramachandran R, Hoffmann P, Galler K, Popp J, Neugebauer U, Hampel K, Zimmermann B, Adam S, Wiendl M, Krönke G, Hamza I, Heinemann SH, Frey S, Hueber AJ, Ohlenschläger** O, Imhof** D
    Sci Rep 2019, 9(1), 16893 * equal contribution, ** co-corresponding authors

2018

  • Cell-based RNAi screening and high-content analysis in primary calvarian osteoblasts applied to identification of osteoblast differentiation regulators.
    Ahmad M, Kroll T, Jakob J, Rauch A, Ploubidou A, Tuckermann J
    Sci Rep 2018, 8(1), 14045
  • A new RelB-dependent CD117+ CD172a+ murine dendritic cell subset preferentially induces Th2 differentiation and supports airway hyperresponses in vivo.
    Andreas N, Riemann M, Castro CN, Groth M, Koliesnik I, Engelmann C, Sparwasser T, Kamradt T, Haenold R, Weih F
    Eur J Immunol 2018, 48(6), 923-36
  • Transcriptomic alterations during ageing reflect the shift from cancer to degenerative diseases in the elderly.
    Aramillo Irizar P, Schäuble S, Esser D, Groth M, Frahm C, Priebe S, Baumgart M, Hartmann N, Marthandan S, Menzel U, Müller J, Schmidt S, Ast V, Caliebe A, König R, Krawczak M, Ristow M, Schuster S, Cellerino A, Diekmann S, Englert C, Hemmerich P, Sühnel J, Guthke R, Witte OW, Platzer M, Ruppin E, Kaleta C
    Nat Commun 2018, 9(1), 327
  • Naked mole-rat transcriptome signatures of socially suppressed sexual maturation and links of reproduction to aging.
    Bens* M, Szafranski* K, Holtze S, Sahm A, Groth M, Kestler HA, Hildebrandt** TB, Platzer** M
    BMC Biol 2018, 16(1), 77 * equal contribution, ** co-senior authors
  • Spatial tissue proteomics quantifies inter- and intra-tumor heterogeneity in hepatocellular carcinoma.
    Buczak* K, Ori* A, Kirkpatrick JM, Holzer K, Dauch D, Roessler S, Endris V, Lasitschka F, Parca L, Schmidt A, Zender L, Schirmacher P, Krijgsveld J, Singer** S, Beck** M
    Mol Cell Proteomics 2018, 17(4), 810-25 * equal contribution, ** co-corresponding authors
  • On the S-layer of Thermus thermophilus and the assembling of its main protein SlpA.
    Farci D, Farci SF, Esposito F, Tramontano E, Kirkpatrick J, Piano D
    Biochim Biophys Acta 2018, 1860(8), 1554-62