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[Translate to deutsch:] Research focus of Subarea 3.

Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns

Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.

Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:

  • vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
  • Genomik in N. furzeri,
  • Epigenetik des Alterns,
  • Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
  • vergleichende Transkriptomik des Alterns.

Forschungsfokus Teilbereich 3.

Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.

Publikationen

(seit 2016)

2025

  • AnchoRNA: Full virus genome alignments through conserved anchor regions
    Eulenfeld** T, Triebel S, Marz** M
    bioRxiv 2025, https://doi.org/10.1101/2025.01. ** co-corresponding authors
  • Analysis of different strains of the turquoise killifish identify transcriptomic signatures associated with heritable lifespan differences.
    Mazzetto M, Reichwald K, Koch P, Groth M, Cellerino A
    J Gerontol A Biol Sci Med Sci 2025 (epub ahead of print)
  • The master male sex determinant Gdf6Y of the turquoise killifish arose through allelic neofunctionalization.
    Richter A, Mörl H, Thielemann M, Kleemann M, Geißen R, Schwarz R, Albertz C, Koch P, Petzold A, Kroll T, Groth M, Hartmann N, Herpin A, Englert C
    Nat Commun 2025, 16(1), 540

2024

  • Quantitative mapping of proteasome interactomes and substrates using ProteasomeID.
    Bartolome A, Heiby* JC, Di Fraia* D, Heinze I, Knaudt H, Spaeth E, Omrani O, Minetti A, Hofmann M, Kirkpatrick JM, Dau** T, Ori** A
    Elife 2024, 13, RP93256 * equal contribution, ** co-corresponding authors
  • [Genetics, epigenetics, and environmental factors in life expectancy-What role does nature-versus-nurture play in aging?].
    Bierhoff H
    Bundesgesundheitsblatt Gesundheitsforschung Gesundheitsschutz 2024, 67(5), 521-7
  • NRF2 activation by cysteine as a survival mechanism for triple-negative breast cancer cells.
    Bottoni L, Minetti A, Realini G, Pio E, Giustarini D, Rossi R, Rocchio C, Franci L, Salvini L, Catona O, D'Aurizio R, Rasa M, Giurisato E, Neri F, Orlandini M, Chiariello M, Galvagni F
    Oncogene 2024 (epub ahead of print)
  • The Aging Synapse: An Integrated Proteomic And Transcriptomic Analysis
    Caterino* C, Ugolini* M, Durso W, Jevdokimenko K, Groth M, Riege K, Görlach M, Fornasiero E, Ori A, Hoffmann S, Cellerino A
    bioRxiv 2024, https://doi.org/10.1101/2024.12. * equal contribution
  • Spatio-temporal variability of airborne viruses over sub-Antarctic South Georgia: Effects of sampling device and proximity of the ocean
    Das R, Malard L, Pearce DA, Rahlff J
    bioRxiv 2024, doi.org/10.1101/2024.08.23.60932
  • Amyloid beta precursor protein contributes to brain aging and learning decline in short-lived turquoise killifish (Nothobranchius furzeri)
    E.M.de Bakker D, Mihaljević M, Gharat K, Richter Y, Bagnoli S, van Bebber F, Adam L, Shamim-Schulze F, Ohlenschläger O, Bens M, Cirri E, Antebi A, Matić I, Schneider A, Schmid B, Cellerino A, Kirstein J, Riccardo Valenzano D
    bioRxiv 2024, https://doi.org/10.1101/2024.10.
  • Epigenetic clock and lifespan prediction in the short-lived killifish Nothobranchius furzeri
    Giannuzzi C, Baumgart M, Neri F, Cellerino A
    bioRxiv 2024, https://doi.org/10.1101/2024.08.