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[Translate to deutsch:] Research focus of Subarea 3.

Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns

Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.

Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:

  • vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
  • Genomik in N. furzeri,
  • Epigenetik des Alterns,
  • Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
  • vergleichende Transkriptomik des Alterns.

Forschungsfokus Teilbereich 3.

Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.

Publikationen

(seit 2016)

2023

  • Maximizing the potential of genomic and transcriptomic studies by nanopore sequencing
    Meyer* D, Göttsch* W, Spannenberg* J, Bohn P, Stieber B, Krautwurst S, Höner zu Siederdissen C, Srivastava A, Zarkovic M, Wollny** D, Marz** M
    bioRxiv 2023, 10.1101/2023.12.06.570356 * equal contribution, ** co-corresponding authors
  • RNA-based sensitive fungal pathogen detection
    Micheel** J, Aron F, Kelani AA, Girbardt C, Blango MG, Walther G, Wollny** D
    bioRxiv 2023, 10.1101/2023.09.26.559494 ** co-corresponding authors
  • A computational framework for testing hypotheses of the minimal mechanical requirements for cell aggregation using early annual killifish embryogenesis as a model.
    Montenegro-Rojas I, Yañez G, Skog E, Guerrero-Calvo O, Andaur-Lobos M, Dolfi L, Cellerino A, Cerda M, Concha ML, Bertocchi C, Rojas NO, Ravasio A, Rudge TJ
    Front Cell Dev Biol 2023, 11, 959611
  • Identification of altered miRNAs and their targets in placenta accreta.
    Murrieta-Coxca JM, Barth E, Fuentes-Zacarias P, Gutiérrez-Samudio RN, Groten T, Gellhaus A, Köninger A, Marz M, Markert UR, Morales-Prieto DM
    Front Endocrinol (Lausanne) 2023, 14, 1021640
  • Author Correction: IFNγ-Stat1 axis drives aging-associated loss of intestinal tissue homeostasis and regeneration.
    Omrani* O, Krepelova* A, Rasa SMM, Sirvinskas D, Lu J, Annunziata F, Garside G, Bajwa S, Reinhardt S, Adam L, Käppel S, Ducano N, Donna D, Ori A, Oliviero S, Rudolph KL, Neri F
    Nat Commun 2023, 14(1), 6302 * equal contribution
  • IFNγ-Stat1 axis drives aging-associated loss of intestinal tissue homeostasis and regeneration.
    Omrani* O, Krepelova* A, Rasa SMM, Sirvinskas D, Lu J, Annunziata F, Garside G, Bajwa S, Reinhardt S, Adam L, Käppel S, Ducano N, Donna D, Ori A, Oliviero S, Rudolph KL, Neri F
    Nat Commun 2023, 14(1), 6109 * equal contribution
  • The Tgf-β family member Gdf6Y determines the male sex in Nothobranchius furzeri by suppressing oogenesis-inducing genes
    Richter A, Mörl H, Thielemann M, Kleemann M, Geißen R, Schwarz R, Albertz C, Koch P, Petzold A, Groth M, Hartmann N, Herpin A, Englert C
    bioRxiv 2023, 10.1101/2023.05.26.542338
  • Navigating the Landscape: A Comprehensive Review of Current Virus Databases.
    Ritsch M, Cassman NA, Saghaei S, Marz M
    Viruses 2023, 15(9)
  • Explaining variation in individual aging, its sources, and consequences: A comprehensive conceptual model of human aging.
    Rothermund K, Englert C, Gerstorf D
    Gerontology 2023, 69(12), 1437-47
  • The African killifish: A short-lived vertebrate model to study the biology of sarcopenia and longevity.
    Ruparelia AA, Salavaty A, Barlow CK, Lu Y, Sonntag C, Hersey L, Eramo MJ, Krug J, Reuter H, Schittenhelm RB, Ramialison M, Cox A, Ryan MT, Creek DJ, Englert C, Currie PD
    Aging Cell 2023, 23(1), e13862