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[Translate to deutsch:] Research focus of Subarea 3.

Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns

Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.

Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:

  • vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
  • Genomik in N. furzeri,
  • Epigenetik des Alterns,
  • Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
  • vergleichende Transkriptomik des Alterns.

Forschungsfokus Teilbereich 3.

Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.

Publikationen

(seit 2016)

2020

  • Expansion of the renal capsular stroma, ureteric bud branching defects and cryptorchidism in mice with Wilms tumor 1 gene deletion in the stromal compartment of the developing kidney.
    Weiss AC, Rivera-Reyes R, Englert C, Kispert A
    J Pathol 2020, 252(3), 290-303

2019

  • C/EBPβ-LIP induces cancer-type metabolic reprogramming by regulating the let-7 /LIN28B circuit in mice.
    Ackermann T, Hartleben* G, Müller* C, Mastrobuoni G, Groth M, Sterken BA, Zaini MA, Youssef SA, Zuidhof HR, Krauss SR, Kortman G, de Haan G, de Bruin A, Wang ZQ, Platzer M, Kempa S, Calkhoven CF
    Commun Biol 2019, 2, 208 * equal contribution
  • Conserved aging-related signatures of senescence and inflammation in different tissues and species.
    Barth* E, Srivastava* A, Stojiljkovic* M, Frahm C, Axer H, Witte** OW, Marz** M
    Aging (Albany NY) 2019, 11(19), 8556-72 * equal contribution, ** co-senior authors
  • Correction to: A miRNA catalogue and ncRNA annotation of the short-living fish Nothobranchius furzeri.
    Baumgart M, Barth E, Savino A, Groth M, Koch P, Petzold A, Arisi I, Platzer M, Marz** M, Cellerino** A
    BMC Genomics 2019, 20(1), 898 ** co-corresponding authors
  • Mitohormetic effects of rotenone drastically depend on age.
    Baumgart* M, Ugolini* M, Groth M, Platzer M, Cellerino A
    bioRxiv 2019, https://doi.org/10.1101/528547 * equal contribution
  • Aging Triggers H3K27 Trimethylation Hoarding in the Chromatin of Nothobranchius furzeri Skeletal Muscle.
    Cencioni* C, Heid* J, Krepelova A, Rasa SMM, Kuenne C, Guenther S, Baumgart M, Cellerino A, Neri F, Spallotta** F, Gaetano** C
    Cells 2019, 8(10), 1169 * equal contribution, ** co-senior authors
  • Cohesin-mediated NF-κB signaling limits hematopoietic stem cell self-renewal in aging and inflammation.
    Chen Z, Amro EM, Becker F, Hölzer M, Rasa SMM, Njeru SN, Han B, Di Sanzo S, Chen Y, Tang D, Tao S, Haenold R, Groth M, Romanov VS, Kirkpatrick JM, Kraus JM, Kestler HA, Marz M, Ori A, Neri F, Morita** Y, Rudolph** KL
    J Exp Med 2019, 216(1), 152-75 ** co-corresponding authors
  • Comment on 'Naked mole-rat mortality rates defy Gompertzian laws by not increasing with age'.
    Dammann* P, Scherag* A, Zak N, Szafranski K, Holtze S, Begall S, Burda H, Kestler HA, Hildebrandt T, Platzer M
    Elife 2019, 8 * corresponding author
  • SilentMutations (SIM): a tool for analyzing long-range RNA-RNA interactions in viral genomes and structured RNAs.
    Desirò D, Hölzer M, Ibrahim B, Marz M
    Virus Res 2019, 260, 135-41
  • Cell cycle dynamics during diapause entry and exit in an annual killifish revealed by FUCCI technology.
    Dolfi L, Ripa R, Antebi A, Valenzano DR, Cellerino A
    Evodevo 2019, 10, 29