[Translate to deutsch:] Research focus of Subarea 3.

Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns

Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.

Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:

vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
Genomik in N. furzeri,
Epigenetik des Alterns,
Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
vergleichende Transkriptomik des Alterns.

Forschungsfokus Teilbereich 3.

Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.

Publikationen

(seit 2016)

2020

Der Türkise Prachtgrundkärpfling – ein Leben im Zeitraffer
Krug J, Richter A, Reuter H, Englert C
BIOspektrum 2020, 26, 375-77
ADAM10 mediates ectopic proximal tubule development and renal fibrosis through Notch signalling.
Li B, Zhu C, Dong L, Qin J, Xiang W, Davidson AJ, Feng S, Wang Y, Shen X, Weng C, Wang C, Zhu T, Teng L, Wang J, Englert C, Chen J, Jiang H
J Pathol 2020, 252(3), 274-89
Biomimetic reconstruction of the hematopoietic stem cell niche for in vitro amplification of human hematopoietic stem cells.
Marx-Blümel L, Marx C, Weise F, Frey J, Perner B, Schlingloff G, Lindig N, Hampl J, Sonnemann J, Brauer D, Voigt A, Singh S, Beck B, Jäger UM, Wang ZQ, Beck JF, Schober A
PLoS One 2020, 15(6), e0234638
Ontogenetic Pattern Changes of Nucleobindin-2/Nesfatin-1 in the Brain and Intestinal Bulb of the Short Lived African Turquoise Killifish.
Montesano* A, Felice* ED, Leggieri A, Palladino A, Lucini C, Scocco P, Girolamo Pd, Baumgart** M, D'Angelo** L
J Clin Med 2020, 9(1) * equal contribution, ** co-corresponding authors
A comprehensive annotation and differential expression analysis of short and long non-coding RNAs in 16 bat genomes.
Mostajo NF, Lataretu M, Krautwurst S, Mock F, Desirò D, Lamkiewicz K, Collatz M, Schoen A, Weber F, Marz M, Hölzer M
NAR Genom Bioinform 2020, 2(1), lqz006
MiR-29 coordinates age-dependent plasticity brakes in the adult visual cortex.
Napoli D, Lupori L, Mazziotti R, Sagona G, Bagnoli S, Samad M, Sacramento EK, Kirkpartick J, Putignano E, Chen S, Terzibasi Tozzini E, Tognini P, Baldi P, Kwok JC, Cellerino* A, Pizzorusso* T
EMBO Rep 2020, 21(11), e50431 * equal contribution
Inclusion of Oxford Nanopore long reads improves all microbial and viral metagenome-assembled genomes from a complex aquifer system.
Overholt WA, Hölzer M, Geesink P, Diezel C, Marz M, Küsel K
Environ Microbiol 2020, 22(9), 4000-13
A virtual "Werkstatt" for digitization in the sciences
Samuel S, Shadaydeh M, Böcker S, Brügmann B, Bucher SF, Deckert V, Denzler J, Dittrich P, Eggeling F, Güllmar D, Guntinas-Lichius O, König-Ries B, Löffler F, Maicher L, Marz M, Migliavacca M, Reichenbach JR, Reichstein M, Römermann C, Wittig A
Res Ideas Outcomes 2020, 6, e54106
Wt1 Positive dB4 Neurons in the Hindbrain Are Crucial for Respiration
Schnerwitzki* D, Hayn* C, Perner B, Englert C
Front. Neurosci. 2020, 14, 529487 * equal contribution
The circuitry between ribosome biogenesis and translation in stem cell function and ageing.
Sharifi'* S, Costa* HFRd, Bierhoff H
Mech Ageing Dev 2020, 189, 111282 * equal contribution