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[Translate to deutsch:] Research focus of Subarea 3.

Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns

Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.

Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:

  • vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
  • Genomik in N. furzeri,
  • Epigenetik des Alterns,
  • Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
  • vergleichende Transkriptomik des Alterns.

Forschungsfokus Teilbereich 3.

Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.

Publikationen

(seit 2016)

2020

  • MiR-29 coordinates age-dependent plasticity brakes in the adult visual cortex.
    Napoli D, Lupori L, Mazziotti R, Sagona G, Bagnoli S, Samad M, Sacramento EK, Kirkpartick J, Putignano E, Chen S, Terzibasi Tozzini E, Tognini P, Baldi P, Kwok JC, Cellerino* A, Pizzorusso* T
    EMBO Rep 2020, 21(11), e50431 * equal contribution
  • Inclusion of Oxford Nanopore long reads improves all microbial and viral metagenome-assembled genomes from a complex aquifer system.
    Overholt WA, Hölzer M, Geesink P, Diezel C, Marz M, Küsel K
    Environ Microbiol 2020, 22(9), 4000-13
  • A virtual "Werkstatt" for digitization in the sciences
    Samuel S, Shadaydeh M, Böcker S, Brügmann B, Bucher SF, Deckert V, Denzler J, Dittrich P, Eggeling F, Güllmar D, Guntinas-Lichius O, König-Ries B, Löffler F, Maicher L, Marz M, Migliavacca M, Reichenbach JR, Reichstein M, Römermann C, Wittig A
    Res Ideas Outcomes 2020, 6, e54106
  • Wt1 Positive dB4 Neurons in the Hindbrain Are Crucial for Respiration
    Schnerwitzki* D, Hayn* C, Perner B, Englert C
    Front. Neurosci. 2020, 14, 529487 * equal contribution
  • The circuitry between ribosome biogenesis and translation in stem cell function and ageing.
    Sharifi'* S, da Costa* HFR, Bierhoff H
    Mech Ageing Dev 2020, 189, 111282 * equal contribution
  • Intestinal stem cells heterogeneity and clonal dominance during aging: two faces of the same coin?
    Sirvinskas* D, Annunziata* F, Neri F
    Mech Ageing Dev 2020, 189, 111247 * equal contribution
  • Tissue-specific Gene Expression Changes Are Associated with Aging in Mice.
    Srivastava* A, Barth* E, Ermolaeva MA, Guenther M, Frahm C, Marz** M, Witte** OW
    Genomics Proteomics Bioinformatics 2020, 18(4), 430-42 * equal contribution, ** co-corresponding authors
  • Nothobranchius annual killifishes
    Terzibasi Tozzini E, Cellerino A
    Evodevo 2020, 11(1), 25
  • Comparison of Multiscale Imaging Methods for Brain Research.
    Tröger J, Hoischen C, Perner B, Monajembashi S, Barbotin A, Löschberger A, Eggeling C, Kessels** MM, Qualmann** B, Hemmerich** P
    Cells 2020, 9(6), E1377 ** co-corresponding authors
  • Active neutrophil responses counteract Candida albicans burn wound infection of ex vivo human skin explants.
    von Müller C, Bulman F, Wagner L, Rosenberger D, Marolda A, Kurzai O, Eißmann P, Jacobsen ID, Perner B, Hemmerich P, Vylkova S
    Sci Rep 2020, 10(1), 21818