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[Translate to deutsch:] Research focus of Subarea 3.

Teilbereich 3: Genetik und Epigenetik des Alterns

Der Schwerpunkt von Teilbereich 3 liegt auf genetischen und epigenetischen Determinanten der Lebens- und Gesundheitsspanne sowie des Alterns bei Fischen, Nagetieren und Menschen. Diese Forschungsrichtung baut auf der Expertise des Instituts in der vergleichenden und funktionellen Genomik auf.

Die Forschung wird durch fünf Schwerpunktbereiche definiert:

  • vergleichende Genomik in kurz- und langlebigen Modellen des Alterns,
  • Genomik in N. furzeri,
  • Epigenetik des Alterns,
  • Nicht-kodierende RNAs im Alterungsprozess,
  • vergleichende Transkriptomik des Alterns.

Forschungsfokus Teilbereich 3.

Um die Ursachen des Alterns zu verstehen, werden vergleichende Genomanalysen in kurz- und langlebigen Modellsystemen durchgeführt. Die funktionelle Genomik soll dabei neue Signalwege identifizieren, die am Altern eines Organismus beteiligt sind und die funktionelle Relevanz genetischer und epigenetischer Veränderungen validieren, die während des Alterns auftreten. Außerdem werden genetische Risikofaktoren für die Entstehung altersbedingter Krankheiten identifiziert und funktional getestet. In der Zukunft werden im Teilbereich Veränderungen in den Wechselwirkungen zwischen Wirt und Mikrobiota während des Alterns untersucht und wie diese die klonale Mutation und epigenetische Veränderungen durch Stoffwechselprodukte und andere Signale beeinflussen.

Publikationen

(seit 2016)

2017

  • Intragenic DNA methylation prevents spurious transcription initiation.
    Neri F, Rapelli S, Krepelova A, Incarnato D, Parlato C, Basile G, Maldotti M, Anselmi F, Oliviero S
    Nature 2017, 543(7643), 72-7
  • Alternative splicing of SMPD1 coding for acid sphingomyelinase in major depression.
    Rhein C, Reichel M, Kramer M, Rotter A, Lenz B, Mühle C, Gulbins E, Kornhuber J
    J Affect Disord 2017, 209, 10-5
  • Massive Effect on LncRNAs in Human Monocytes During Fungal and Bacterial Infections and in Response to Vitamins A and D.
    Riege K, Hölzer M, Klassert TE, Barth E, Bräuer J, Collatz M, Hufsky F, Mostajo N, Stock M, Vogel B, Slevogt H, Marz M
    Sci Rep 2017, 7, 40598
  • MicroRNA miR-29 controls a compensatory response to limit neuronal iron accumulation during adult life and aging.
    Ripa R, Dolfi L, Terrigno M, Pandolfini L, Savino A, Arcucci V, Groth M, Terzibasi Tozzini E, Baumgart M, Cellerino A
    BMC Biol 2017, 15(1), 9
  • Positive Selektion in langlebigen Nagern und kurzlebigen Fischen : eine bioinformatische Suche nach der genetischen Basis des Alterns
    Sahm A
    Dissertation 2017, Jena, Germany
  • Parallel evolution of genes controlling mitonuclear balance in short-lived annual fishes.
    Sahm A, Bens M, Platzer M, Cellerino A
    Aging Cell 2017, 16(3), 488-96
  • PosiGene: automated and easy-to-use pipeline for genome-wide detection of positively selected genes.
    Sahm A, Bens M, Platzer M, Szafranski K
    Nucleic Acids Res 2017, 45(11), e100
  • (Anti-)parallel evolution of lifespan.
    Sahm A, Cellerino A
    Aging (Albany NY) 2017, 9(10), 2018-9
  • How the Wilms tumor suppressor gene Wt1 affects interneurons in the central nervous system
    Schnerwitzki D
    Dissertation 2017, Jena, Germany
  • Cell autonomous expression of CXCL-10 in JAK2V617F-mutated MPN.
    Schnöder TM, Eberhardt J, Koehler M, Bierhoff HB, Weinert S, Pandey AD, Nimmagadda SC, Wolleschak D, Jöhrens K, Fischer T, Heidel FH
    J Cancer Res Clin Oncol 2017, 143(5), 807-20